股東大會是南陽村鎮銀行最高的權力機構，由全體股東組成，股東以其所持股份數額行使表決權。股東大會主要負責決定南陽村鎮銀行的經營方針和投資計劃；選舉和更換董事，決定有關董事的報酬事項；選舉和更換由非職工代表擔任的監事，決定有關監事的報酬事項；審議批準董事會和監事會工作報告；審議批準南陽村鎮銀行的年度財務預算方案和決算方案；審議批準南陽村鎮銀行的利潤分配方案和彌補虧損方案；對增加或減少注冊資本作出決議；決定南陽村鎮銀行發行債券和首次公開發行股份；對南陽村鎮銀行的合并、分立、解散、清算等事項作出決議；制定和修改章程；審議通過股東大會議事規則等重大事項。